井水净化则比较复杂，不同地方的井水情况不一样，比如黄土高坡的地下水普遍含氟过高，卡斯特地貌的地下水普遍含钙过高（俗称硝），还有一些地下水含铁锰过高，各地情况差别很大，处理方式也大相径庭。总之处理必须要有针对性，事前应该进行水质化验，然后根据化验结果进行针对性的净化处理。目前这些处理方法都比较成熟。

除了上面去除水中超标矿物质外，通常还要对井水进行除浊净化，这方面选用物理过滤的方式较好，初级过滤可选用砂缸过滤，中级过滤可以选用PP棉芯、陶瓷芯过滤，更深一级过滤可选用中空超滤过滤，精度可达0.01UM，细菌病毒都能过滤掉。

井水处理包含两方面：一是对井水进行增压，二是对井水采取净化。

井水增压目的是让井水用起来像用自来水一样随时都有压力，井水增压包含井水从井中汲取出来，并维持一定的压力，以及如何控制水泵、保护水泵、压力维持等控制系统两方面。