马来西亚海洋资源丰富，尤其是其东部地区，整个东马海岸线曲折迂回，形成众多港湾，密集分布的岛屿、珊瑚礁，水文状况复杂，且注入的河流众多，及雨量充沛、水质肥沃等，饵料丰富， 适合鱼类生长繁殖。
马来西亚的鱼类消耗量排世界第四，仅次于马尔代夫、冰岛和日本。然而，2003年以前的10年，由于过度捕捞，沿岸的海洋资源损害严重，马来西亚政府不得不限制渔民的数量。从2003年起，经过科学调查发现，马来西亚的海洋资源已经得到恢复，政府允许渔民重新开始捕捞活动。
尽管近年来深海捕捞和养殖业有所发展，但马来西亚渔业以近海捕捞为主，90%以上渔船仍集中在靠近沿海作业，渔船吨位小、装备陈旧、生产技术落后。目前，马来西亚政府已经意识到制约深海渔业发展的瓶颈，除了深海渔业设备和技术等因素外，还由于天然渔业港口少而小，加工、冷冻、制冰等基础设施薄弱。为此，早在2005年，马政府在渔业发展规划中增加相当于9亿元人民币的拨款，用来扩建有关渔业码头、改进基础设施。同时，为了吸引当地企业对渔业基础设施的投资，政府给予低息贷款、相关税收减免以及先征后退等优惠政策来鼓励当地企业积极发展深海渔业。
2005年10月，马来西亚成立国家渔业公司。该公司的主要任务是形成捕鱼舰队，改善鱼类处理，有效营销以及稳定价格机制，在渔业领域里促进新产品和企业的发展，制造新的渔业就业机会，提升本地渔业技术和科技，发展渔港设施等。
据报道，2007年5月，经中国和马来西亚两国相关部门批准，广西北海市远洋渔业发展有限公司与马来西亚安格渔业发展有限公司合作，将开始在马来西亚海域进行渔业生产活动。2007年5月18日，在马来西亚首都吉隆坡举行的中国广西－马来西亚贸易投资洽谈会上，双方就相关合作意向签署协议。这也是广西企业首次获准在东盟国家开展远洋捕捞合作。
目前马来西亚有500余艘泰籍深海捕捞船只在该国海域开展渔业生产，而本国却只有50余艘深海作业船只。北海市远洋渔业发展有限公司有着数十年的远洋渔业合作经验，拥有成熟的渔业生产技术和较强的实力，双方合作前景十分看好。马来西亚深海捕鱼协会希望马深海捕鱼在今后5年里每年创造产值7117万美元。
在加强深海捕捞的同时，近年来，马来西亚着力提高水产养殖能力。马来西亚农业部和食品工业部负责人前不久表示，到2010年，马来西亚希望水产养殖产量达到193万公吨，他们认为水产养殖非常有发展潜力，因此将大力推动发展鱼类养殖业。国家已经划定了作为水产养殖场的区域，并指定商业银行负责分析鉴定哪些区域适合养殖哪一种类水产品，农业部也将选择最适合的公司和个人参加到这个项目中来，另外，渔业部也鼓励私有企业更多地向该计划投资。
目前，相关银行正在从其他金融机构筹集资金，为水产工业提供适量贷款，更多的渔民将有机会加入水产养殖业和深海捕捞，国家也将培养一批能够运用现代科学技术加工和销售水产品的企业家。
通过发展深海捕捞和水产养殖业，马来西亚希望水产品消费从现在的人均49公斤增长到2010年的56公斤。
