在协定下，澳洲将捐出28艘总值将近330万美元（大约500万新元）的高速炮艇给菲律宾军方，菲律宾则誓言制止国内的政治谋杀事件。
协定在澳洲首都坎贝拉签署，到访的菲律宾总统阿罗约和澳洲总理霍华德都出席了签署仪式，这是阿罗约第一次到澳洲进行正式访问。
阿罗约在签约后同霍华德举行的联合记者会上说：“安全协定将协助菲律宾武装部队进行现代化和专业化，它在反恐上也将加强两国军警的运作能力。”
霍华德在讲话时指出，反恐演习是在菲律宾成功抗拒恐怖主义的基础上展开的。他说：“菲律宾并没有因此而自满，双方都不能自满，应该进行更紧密的合作，特别是涉及反恐的演练。”
根据协定，菲澳两国也将举行大规模的联合军事演习。菲律宾同美国已签署了类似的协定，以对付菲律宾南部同卡伊达有联系的恐怖组织和其他叛乱分子。
菲律宾国防部长艾布丹尼说，澳洲军队在菲律宾境内的反恐行动将不会肩负战斗任务。
阿罗约过后在澳洲国会大厦的午餐会上也表示感激澳洲同意提供20多万美元（31万新元），协助菲律宾摆脱政治暴力和仇敌的多代历史包袱。
她誓言：“就像经济一样，我们将逐步、稳健、信心十足地制止长期以来的暴力行为。”
联合国人权专家多次指责菲律宾政府无法制止谋害政治活跃分子的行为，人权分子说，自从阿罗约在2001年上台以来，已经有800多人怀疑是被保安部队人员打死。
