根据《中国－东盟自由贸易区全面经济合作框架协议》，中国-东盟自由贸易区的宗旨和作用之一是最大限度地降低壁垒，加深各缔约方之间的经济联系。《货物贸易协议》规定，依照本协议纳入关税削减或取消计划的税目，应包括所有未被《框架协议》所列的早期收获计划涵盖的税目，这些税目分正常类和敏感类进行削减或取消关税。
按照《货物贸易协议》规定的商品减税时间表，第一类正常产品的降税安排为：中国和东盟六国：2005年40%的产品将税率降至5%以下；2007年60%的产品将税率降至5%以下；2010年100%的产品将税率降至零；越、老、柬、缅：2009年40%的产品将税率降至5%以下；2013年40%的产品将税率降至零；2015年100%的产品将税率降至零。第二类正常产品在关税降至5%之前与第一类正常产品同时降税，但降至5%后可保持至2012年再降至零。
同时协议还规定了敏感产品的降税计划，其中，一般敏感产品：中国和东盟六国：2012年削减到20%以下，2018年削减到5%以下；越、老、柬、缅：2015年削减到20%以下，2020年削减到5%以下；高度敏感产品：中国和东盟六国：2015年削减到50%以下；越、老、柬、缅：2018年削减到50%以下。
2003年10月1日，中泰蔬菜水果零关税安排作为早期收获的一部分开始实施，产品涵盖范围为《税则》第七章蔬菜、第八章水果，并立刻实现零关税。
2004年1月1日起，《框架协议》下的早期收获计划开始实施，除菲律宾暂时未能加入早期收获计划外，中国与其他东盟九国开始就早期收获计划之内的产品进行关税削减，拉开了中国-东盟自由贸易区的降税序幕。早期收获计划的涵盖范围主要有570种产品，另外还有出于贸易利益平衡考虑而增加的30多种特定产品。至2006年1月1日，中国和所有东盟老成员的早期收获产品降税实施完毕。
2005年4月，中国与菲律宾就早期收获计划达成协议，在2006年1月1日相互立即实现早期收获产品零关税。
2005年7月20日，《中国-东盟全面经济合作框架协议货物贸易协议》正式公布，中国-东盟自贸区货物贸易降税全面开始。按规定，双方开始对约7000个税目的产品开始削减关税。5年内它们中的大部分产品关税将降至为零，部分敏感产品则将分步进行。开放的产品约占目前中国和东盟贸易产品总额的95%。中国和东盟中文莱、印度尼西亚、马来西亚、缅甸、新加坡和泰国等六个国家开始相互实施中国-东盟自由贸易区协定税率。柬埔寨、老挝、菲律宾和越南因尚未完成国内相关法律程序，故暂没有实施协定税率。
2005年12月11日，中国与柬埔寨、老挝和缅甸三国在马来西亚吉隆坡签署换文，正式确认中国将自2006年1月1日起对柬埔寨的83项、老挝的91项、缅甸的87项输华产品实行单方面零关税待遇。
